İçerik
- TL; DR (Çok Uzun; Okumadı)
- Elektroforez Nedir?
- Tatminkar Olmayan Jel Hazırlama
- Çok fazla örnek
- Düşük Kalite Örneği
Bilim adamlarının DNA'nız gibi küçük parçaları nasıl incelediklerini hiç merak ettiniz mi? Bir yöntem jel elektroforezidir. Elektroforez genellikle bilimsel yorumlama için mükemmel net, okunması kolay bantlar oluştururken, bulaşmış sonuçlar bazen verileri gizler.
TL; DR (Çok Uzun; Okumadı)
Jel elektroforezi, bilim insanlarının sindirilmiş örnekleri görselleştirmelerini ve parçaların boyutlarını ölçmelerini sağlar. Bulaşma, yanlış hazırlanmış agaroz jellerinden, seyreltilmemiş bir numuneyi kuyucuklara yerleştirmek veya düşük kaliteli numuneler kullanmaktan kaynaklanır.
Elektroforez Nedir?
Jel elektroforezi, bilim insanlarının, DNA gibi küçük moleküllerin sindirilmiş örneklerini görselleştirmelerinin ve bu parçaların boyutlarını tahmin etmelerinin bir yoludur. Elektroforez yapmak için, bilim adamları kaynayan suda agarozu askıya alarak bir jel hazırlarlar. Elde edilen polimerizasyon çapraz çapraz şeker polimerleri üretir, böylece jel kimyasal seviyede örümcek ağı gibi görünebilir.
Bilim adamları, jelde kuyu oluşturmak için bir kesme aleti kullanır, böylece kuyulara çok az miktarda sindirilmiş numune yükleyebilirler. Makinenin açılması elektriğin jelin içinden akmasına neden olur ve numunelerdeki fragmanlar kuyulardan jelin diğer tarafına geçmeye başlar. Jel ağ-yapılı olduğu için, daha küçük parçalar matristen hızlı bir şekilde geçerken, daha büyük parçalar matris boyunca tırmanmak için daha uzun zaman alır. Tamamlandığında, jel farklı parçaların ne kadar uzağa gittiğini temsil eden koyu renkli bantlar içerir. Bilim adamları bu bantları ölçer ve ne kadar göç ettiklerini temel alarak her bir parçanın boyutunu belirlemek için logaritmik bir hesaplama kullanır.
Bilim adamları açık bantları umuyor, ancak bazen gruplar bulaşıyor. Bu lekelenme, genellikle, iyi hazırlanmış olmayan jellerin kuyucuklara seyreltilmemiş numuneleri veya düşük kaliteli numuneleri doldurmasının sonucudur.
Tatminkar Olmayan Jel Hazırlama
Lekelenmiş sonuçlara gelince, olası bir suçlu kötü hazırlanmış bir jeldir. Tatminkar bir jel eşit biçimde polimerize olur ve döküm tepsisindeki jel boyunca homojen bir matris oluşturur. Jelin bir kısmı - genellikle alt yarı - bilim insanının tüm tepsiyi dökmeyi bitirmesinden önce belirlenirse, ortaya çıkan jel düzensiz olur ve lekeli sonuçlar verir.
Çok fazla örnek
Numuneleri oyuklara yüklemeden önce, bu numunelerin oyuklardan taşmadan jel içinden geçecek kadar seyreltilmesi gerekir. Eğer dolu bir örnek, bilim insanının sulandırmayı unuttuğu veya uygun olmayan bir sulandırma faktörü kullandığı için çok konsantre olması durumunda, parçalar kuyular için çok büyük olacak ve lekelenmeye neden olacaktır.
Düşük Kalite Örneği
Bulaşma aynı zamanda düşük numune kalitesinden de kaynaklanır. Örneğin, proteinle kontamine olmuş veya çok fazla tuz içeren bir DNA örneği bulaşmaya neden olabilir. Bozulmuş veya denatüre olmuş numuneler de lekeli bantlar dahil olmak üzere zayıf sonuçlar verir.
Jel elektroforezi, bilim insanlarının sindirilmiş örnekleri görselleştirmeleri ve parça büyüklüğünü belirlemeleri için harika bir yoldur. Hem jelin hem de numunenin dikkatlice hazırlanması, bulaşma olasılığını en aza indirir ve bilimsel yorumlama için ideal olan net bantlar verir.