İçerik
- DNA Çift Sarmal Model
- DNA Çift Sarmal Modelinin Oluşturulması
- Modelin Montajı
- Twist yapmak
- Modeli Etiketle
Deoksiribonükleik asit (DNA) modelleri, Rosalind Franklin tarafından çekilen X-ışını kırınımı resimleriyle başladı. Fotoğrafları Francis Crick ve James Watson'a şu an ünlü çift sarmal olan üç boyutlu DNA modelini tamamlamalarına yardımcı oldu.
DNA modelleri satın alınabilse de, bir model inşa etmek yapıyı anlamamıza yardımcı olur.
DNA Çift Sarmal Model
DNA çift sarmal modelinde altı parça bulunur. Modelin omurgası veya yanları deoksiriboz molekülleri ile değişen fosfat moleküllerinden oluşur. DNA molekülünün azotlu bazları, fosfat molekülleri ile değil, sadece deoksiriboz molekülleri ile bağlanır.
DNA molekülünün basamaklarının yaklaşık yüzde 60'ı adenin-timin azotlu bazlardan yapılır. Basamakların yaklaşık yüzde 40'ı guanin-sitozin bazlardan yapılır. Modelin 10 basamağı varsa, altı basamak adenin-timin basamağı olacak ve kalan dört basamak guanin-sitozin basamağı olacaktır.
Adenin ve timin iki hidrojen bağı ile bağlanırken guanin ve sitozin üç hidrojen bağı ile bağlanır. Adenin, sitozinle bağlanamaz ve guanin, hidrojen bağlarıyla uyuşmadığından timinle bağlanamaz. (Bkz. DNA molekülü oluşturma pratiği için Kaynaklar.) Adenin ve guanin, timin ve sitozin tek halka moleküllerinden biraz daha büyük olan çift halka molekülleridir.
Azotlu basamaklar her zaman aynı bazda aynı bazla yönlendirilmez, yani adenin-timin basamağı bazen adenin sol tarafta olacak ve bazen de timin solda olacaktır. Guanin ve sitozin de taraf değiştirebilir.
DNA molekülü çift sarmal oluşturur. Yapı etrafında ve çevresinde bükülmüş bir merdivene benziyor. Model bu şekli yansıtmalıdır.
DNA Çift Sarmal Modelinin Oluşturulması
DNA modelini payetlerle oluştur. Bu yönler, omurga tarafları için boncuklar ve basamaklar için kamışlar kullanır.
Malzeme seçimi: Deoksiriboz molekülü için boncuklar, pipetin çapına eşit veya biraz daha büyük bir çapa sahip olmalıdır. Beyaz ve siyah gibi iki renkte midilli boncuklar iyi çalışacaktır.
Model, kamışların ve boncukların arasından dokunacak kadar esnek, modelin üç boyutlu şeklini tutacak kadar sağlam bir bağlantı malzemesi gerektirir. Çiçekçiler tel veya boru temizleyicileri çalışacaktır.
Dört azotlu bazı ayırt etmek için şeffaf veya yarı saydam pipetler kullanın ve kamış bölümlerinden renkli boru temizleyicileri sokun. Örneğin, adenin için sarı, timin için yeşil, guanin için kırmızı ve sitozin için mavi kullanın. Omurgalar için beyaz veya siyah boru temizleyicileri veya çiçekçi teli kullanın.
Omurgayı inşa etmek: DNA molekülünün iki tarafı veya omurgası vardır. En az 20 boncuk uzunluğunda (10 beyaz ve 10 siyah boncuk) bir boncuk uzunluğu oluşturmak için boru temizleyiciyi veya çiçekçi tellerini alternatif siyah ve beyaz midilli boncuklarından geçirin. Karşı tarafı oluşturmak için tekrarlayın. Her bir omurga boyunca fazladan birkaç boncuk ekleyebilirsiniz.
Basamakları bina: Uygun adenin-timin ve guanin-sitozin oranını gösteren bir model oluşturmak için altı adenin-timin baz çifti ve dört guanin-sitozin baz çifti oluşturun. Her biri 2 inç uzunluğunda olan 10 bölüm pipet kesilerek başlayın.
Adenin-timin baz çiftleri
Hafifçe merkezden uzak, V şeklinde veya açılı kesim kullanarak altı tane saman bölümünü kesin.
Altı adet 2-inç sarı boru temizleyici (adenin için) ve altı adet 2-inç yeşil boru temizleyici (timin için) kesin.
Sarı boru temizleyiciyi daha uzun saman parçalarına ve yeşil boru temizleyiciyi daha kısa saman parçalarına geçirin.
Guanin-sitozin baz çiftleri
Merkezden biraz çıkınca, kalan dört saman bölümünü kavisli bir kesim kullanarak ayırın.
Dört adet 2 inç uzunluğunda kırmızı boru temizleyicisi (guanin için) ve dört adet 2 inç uzunluğunda mavi boru temizleyicisi (sitozin için) kesin.
Kırmızı boru temizleyiciyi daha uzun saman parçalarına ve mavi boru temizleyiciyi daha kısa saman parçalarına geçirin.
Basamakları bağlama: Basamakları ve modeli monte etmek için iğne burunlu pense kullanın.
Bir adenin ve bir timin saman bölümünün açılı kesim uçlarını eşleştirin. Boru temizleyici bölümlerinin uçlarında bir kanca oluşturmak için pense kullanın. Sarı ve yeşil boru temizleyicileri birbirine bağlayın ve parçaları bir arada tutmak için kancaları kapatın. Altı adenin-timin basamağı oluşturmak için tekrarlayın.
Bir guaninin ve bir sitozin samanı bölümünün kavisli uçlarını eşleştirin. Boru temizleyici uçlarını takın ve adenin-timin basamaklarıyla yaptığınız gibi bağlayın. Dört guanin-sitozin basamaklarını oluşturmak için tekrarlayın.
Modelin Montajı
Omurgadaki beyaz veya siyah midilli boncukların deoksiriboz moleküllerini temsil edip etmeyeceğine karar verin. Bazlar sadece bu renge yapışacaktır.
Bu örnekte, siyah boncuk deoksiribozu temsil etsin. Boru temizleyicinin ucunu boncukları tutan tel veya boru temizleyicinin içine sokarak bir adenin-timinin veya bir guanin-sitozin basamağının bir ucunu takın. Fazla boru temizleyici uzunluğuna sahip olmalısınız.
10 basamakın tümü bir omurgaya tutturulana kadar her basamağı siyah bir taneye bağlayarak tekrarlayın. Unutmayın, adenin veya guanin bazlarının tümü modelin aynı tarafına yapışmayacaktır.
Her basamağın karşıt ucunu, ikinci omurgada siyah bir boncuk bağlayın. Model şimdi merdiven gibi görünmeli.
Sıraları konumlandırın, böylece hizalayın. Boru temizleyicilerin uçlarını, model stabil ve biraz sert olacak şekilde sıkın. Gerekirse boru temizleyicilerin uçlarını kesin.
Twist yapmak
DNA molekülü çift sarmal oluşturur. Modeli kaldırın ve modeli dikkatlice spiral şeklinde bükün.
Modeli Etiketle
Modeli etiketleyin veya modelin öğelerini tanımlamak için bir anahtar oluşturun.