İçerik
- DNA Arıtımı için Etilendiaminetetraasetat
- DNA Amplifikasyonu için Magneisum Klorür
- DNA Boyama için Ethidium Bromide
DNA'nın analizi farklı tip moleküler deneyleri ve biyolojik prosedürleri içerir. DNA kırılgan ve karmaşık bir hammaddedir, bu nedenle kullanımı ve analizi kimyasalların en iyi kalitede ve en saf şekilde hazırlanmasını gerektirir. Analize bağlı olarak, asidik ve bazik çözeltilerden tamponlara ve boyalara kadar yüzlerce kimyasal DNA incelemesinde yer almaktadır. Bazı kimyasalların neden kullanıldığını anlamak, başarılı deneyler yapmak ve doğru, güvenilir ve tekrarlanabilir sonuçlar elde etmek için anahtardır.
DNA Arıtımı için Etilendiaminetetraasetat
Bilimsel çalışmalar için üç çeşit DNA saflaştırılır: genomdan DNA (genomik DNA), hücreden DNA'nın tamamı (toplam DNA) veya kendinden çoğalabilen plazmidlerden. Toplam hücre DNA saflaştırması, hücre parçalanması sırasında bir hücrenin birçok zarının tahrip olmasına izin veren kimyasallar kullanır. Kimyasal etilendiamintetraasetat (EDTA), genellikle hücre duvarlarının sertliğini korumak için gerekli olan magnezyum iyonlarını uzaklaştırmak için kullanılır; bu, bunların hücre parçalarını ve DNA'yı analiz için serbest bırakarak çökmelerine veya yırtılma noktalarına kadar zayıflamalarına neden olur. Ek olarak, EDTA, hücrede normalde bulunan enzimleri inhibe ederek DNA'yı parçalayabilir ve kullanılamaz hale getirebilen DNA bütünlüğünü korur ve korur.
DNA Amplifikasyonu için Magneisum Klorür
Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), bir DNA molekülünün bin kopyasını çoğaltmak için kullanılan karmaşık bir analiz yöntemidir, ancak teknik problemlerle ve yanlışlıklarla doludur. Bu nedenle birçok bilim adamı, ilgilenilen belirli bir gen için en uygun koşulu ve parametreleri bulmak için rutin olarak birkaç farklı PCR seti gerçekleştirir. Böyle bir optimizasyonu gerçekleştirmek için kullanılan bir kimyasal, PCR'de kullanılan DNA polimeraz enzimini stabilize eden ve enzimin aktivitesi için temel bir ko-faktör olarak görev yapan magnezyumdur. PCR'ler için magnezyum, bir magnezyum klorür tamponu formunda kullanılır.
DNA Boyama için Ethidium Bromide
Ethidium bromid, DNA'nın çift sarmalını oluşturan nükleotitler arasına girerek interkalasyon olarak bilinen bir işlemde kaynayarak DNA'ya bağlanan bir boyadır. Bu boya daha sonra bir ultraviyole lamba ile aydınlatılabilir, böylece etidyum bromürün bağlandığı DNA görselleştirilebilir. Bununla birlikte, etidyum bromürün düzgün görülmesi için en az 1 nanogram DNA gereklidir, bu nedenle PCR ile büyütülmüş DNA'yı tespit etmenin bir yoludur. Ucuz ve yaygın olarak kullanılmasına rağmen, aynı zamanda kansere neden olduğu bilinen bir mutajenik kimyasaldır, bu nedenle laboratuvarlarda kullanımı oldukça düzenlenir ve birçok bilim adamı daha az toksik alternatif kullanmaya geçiyor.