İçerik
- Amino Asitlerden Protein Üretimi
- Amino Asitler Arasındaki Peptid Bağları
- Amino Asitlerin Yan Zincirleri
- Amino Asit Siparişi ve Protein Katlanması
- Yan Zincirler ve Katlama
- Amino Asit Kombinasyonlarının Sayısı
Amino asitlerin uzun zincirlerine veya polimerlerine protein denir (proteinlerin sadece amino asitler olmasına gerek yoktur). Amino asitler “peptid bağları” ile bağlanır. Amino asitlerin sırası, DNA genindeki nükleotitlerin (genetik “alfabe”) sırasına göre belirlenir ve bu da proteinin nasıl katlanıp işlediğini belirler.
Amino Asitlerden Protein Üretimi
Amino asitleri proteinlere bağlama işlemi hücre çekirdeğinde başlar. Bir gen için Messenger RNA (mRNA), bir şablon olarak bir DNA gerilmesi kullanılarak oluşturulur. MRNA daha sonra çekirdeğin dışına “ribozom” adı verilen protein üreticilerine gider. Burası proteinin yapıldığı yerdir. Ribozomlarda, transfer RNA (tRNA) daha sonra amino asitleri mRNA'ya yapışır. Temel olarak mRNA, proteini oluşturmak için bir şablon olarak kullanılır.
Amino Asitler Arasındaki Peptid Bağları
Amino asitler uzun doğrusal polimerlerde baştan kuyruğa birleştirilir. Spesifik olarak, bir amino asidin karboksilik asit grubu (-CO), diğerinin amino grubuna (-NH) bağlanır. Bu bağa "peptid bağı" denir. Bu tür amino asit zincirlerine "polipeptitler" denir.
Amino Asitlerin Yan Zincirleri
Amino asitler, merkezi karbon atomuna bağlı yan zincirlere sahiptir. Bu yan zincirler farklı elektrostatik (yapışma) özelliklere sahiptir. Bu, başlangıçta lineer proteinin, mRNA şablonundan salındığında nasıl katlandığı konusunda önemlidir.
Amino Asit Siparişi ve Protein Katlanması
Protein şekli, amino asit dizisi tarafından belirlenir. Uzun bir polipeptit zincirindeki bağlar, proteinin omurgasını büyük bir esneklik sağlayan atomların serbestçe dönmesine izin verir. Bununla birlikte, çoğu polipeptit zinciri, sadece bir şekle katlanır ve çoğu bunu kendiliğinden yapar.
Yan Zincirler ve Katlama
Katlama, amino asitlerin yan zincirlerinin sırasına göre belirlenir. Bu yan zincirler hücrede bulunan su ve her biri ile etkileşime girer. Kutuplu yan zincirler suya bakacak şekilde bükülme eğilimindedir. Polar olmayan yan zincirler, hidrofobik (su sevmeyen) protein topunun merkezine dönüşür. Polar ve kutupsal olmayan bölgelerin dağılımı bu nedenle proteinin katlanmasını düzenleyen en önemli faktörlerden biridir.
Amino Asit Kombinasyonlarının Sayısı
Protein yapmak için 20 amino asit kullanılır. Uzun n amino asitleri olan 20 ^ n farklı polipeptitler olmasına rağmen, sonuçta ortaya çıkan proteinlerin çok küçük bir kısmı stabil olacaktır. Çoğu, eşdeğer enerji seviyelerine sahip çok sayıda şekle sahip olacaktır. Farklı bir enerji seviyesini benimsemek için şekli kolayca değiştirebildikleri için, organizma için yararlı olacak kadar kararlı olmazlardı. Yanlış yerdeki bir amino asit bu nedenle bir proteini işe yaramaz hale getirebilir. Bu nedenle, DNA'daki çoğu mutasyon organizmaya fayda sağlamaz. Sadece muazzam miktarda deneme ve yanılma yoluyla, faydalı proteinler gelişti.