İçerik
Toprak kirliliğinin birçok nedeni var. Kirletici maddeler doğrudan tanıtılabilir. Çökelti, kükürt dioksit ve azot oksit gibi asidik bileşikler biriktirdiğinde toprak hava kirliliği ile kirlenebilir. Madencilik gibi insan faaliyetleri, yaygın etkileri olan asidik drenajı serbest bırakabilir. Sebep ne olursa olsun, toprak kirliliğinin bitkilere ve bitki örtüsüne ve bunlara bağlı organizmalara olumsuz etkileri vardır.
Mikroorganizmalar
Sülfür dioksit gibi asidik bileşiklerin birikmesiyle oluşan asitli topraklar, organik materyali parçalayarak ve su akışına yardımcı olarak toprak yapısını geliştiren mikroorganizmalar tarafından tolere edilmeyen asidik ortamlar üretir.
Fotosentez
Asit yağmuru ile kirlenen topraklar, toprak kimyasını bozarak ve bitkileri besin alma ve fotosenteze maruz kalma yeteneğini azaltarak bitkiler üzerinde etkilidir.
Alüminyum
Alüminyum, çevrede doğal olarak meydana gelirken, toprak kirliliği, bitkiler için oldukça toksik olan ve potansiyel olarak yeraltı sularına sızabilen ve etkilerini artıran inorganik formları harekete geçirebilir.
Algal Blooms
Yüksek düzeyde azot ve fosfor içeren kontamine olmuş topraklar su yollarına sızarak alg çiçeklenmelerine neden olur, bu da suda çözünmüş oksijen nedeniyle su bitkilerinin ölümüne neden olur.
pH
Toprağa asidik birikme, toprak pH'ındaki değişiklikleri tamponlama kabiliyetini engelleyebilir ve bitkilerin kabul edilemez koşullar nedeniyle ölmesine neden olabilir.