İçerik
Bilim adamları, DNA molekülünü dizileme yeteneğine sahiptir; Başka bir deyişle, herhangi bir molekülde nükleotit bazlarının sırasını belirleyebilirler. DNA molekülünün sekanslanması, bir DNA molekülündeki spesifik nükleotitlerin birbirleriyle nasıl etkileşime girdiğini ve bir organizmada farklı karakteristikler kodladığını ortaya koymak için gereken birkaç adımdan ilki olabilir. DNA dizilim süreci oldukça dahil olmakla birlikte, otomatik DNA diziciler işlemin en azından bir kısmı için ihtiyaç duyulan insan katılımını en aza indirmektedir.
Örnek hazırlama
Otomatik bir DNA dizileyicinin çalışması için DNA'yı oluşturan dört nükleotit bazını tespit etmesi gerekir: adenin, guanin, timin ve sitozin. Bilim adamları, bir DNA parçasını birçok kez kopyalar ve DNA'yı farklı boyutlarda parçalara kesmek için kısıtlama enzimlerini kullanır. Daha sonra her bir DNA partisine az miktarda flüoresan etiketli baz eklerler. Adenin, timin, guanin veya sitozin olan baz, bir telin ucundaki baz komplemanına yapışacaktır. Örneğin, adenin, timin ile biten tellere bağlanır ve guanin, sitozin ile biten tellere bağlanır.
Otomatik DNA Sıralayıcısı Yapımı
Otomatik bir DNA dizici, daha fazla el emeği gerektiren bir DNA dizici gibi inşa edilmiştir. Spesifik olarak, bir otomatik DNA sekansörü, içine DNA'nın dökülebildiği 96 jel kuyusu olan, yaklaşık 1 metre uzunluğunda bir tanktır. Otomatik bir DNA diziliminde, tıpkı herhangi bir DNA diziliminde olduğu gibi, DNA, tankın tepesindeki jel yuvalarına enjekte edilir ve tankın bu ucuna negatif bir yük uygulanır. Negatif yük, DNA iplikçiklerinin tankın sonuna kadar farklı mesafelerde hareket etmeleri için güçlü bir ivme sağlar.
Otomatik Enjeksiyon
Otomatik bir DNA dizici, DNA kümelerini otomatik olarak jelin üstüne enjekte eder. Bu nedenle, araştırmacılara muazzam miktarda zaman ve çaba kazandırır. Seriler enjekte edildikten sonra, sıralayıcı otomatik olarak tankın bir ucuna negatif bir yük uygulayarak ipliklerin jel boyunca değişen mesafelerde hareket etmesine neden olur. Farklı mesafeler, jelden geçen farklı boyuttaki DNA iplikçiklerini yansıtır.
detektör
Pek çok otomatik DNA dizilim makinesi, jel içinden geçen DNA iplikçiklerinde flüoresan boyayı tespit etmek için kurulmuştur. Bunu yaparken, tellerin ucundaki nükleotidleri tanımlayabilir ve bunları bilgisayara kaydedebilirler. Bununla birlikte, sekanserler, en iyi ihtimalle, DNA nükleotidlerinin karıştırılmış bir versiyonunu sunar. Otomatik bir DNA sıralama makinesini kullandıktan sonra, bilgisayarların ve araştırmacıların bir kombinasyonunun, verileri bir DNA şeridinin kapsamlı bir tanımına birleştirmeyi tespit eden DNA şeridinden elde ettiği sonuçları ayırdığı "son işlem" adı verilen bir işlemden geçmelisiniz. Şaşırtıcı olmayan bir şekilde, bu işlem gerçek sıralama işleminden daha uzun sürebilir.