İçerik
- Genel DNA Ekstraksiyonu
- Bitki ve Hayvan Hücreleri
- Bitki DNA Ekstraksiyonu
- Hayvan DNA Ekstraksiyonu
- DNA Farklılıkları
Çift sarmallı DNA'nın yapısı tüm canlı hücrelerde evrenseldir, ancak genomik DNA'nın hayvan ve bitki hücrelerinden çıkarılması yöntemlerinde farklılıklar ortaya çıkar. Her ne kadar genomik DNA hücre çekirdeğinde yaşarsa da, çıkarılan DNA'nın miktarı ve saflığı hücrenin türüne ve boyutuna bağlıdır. Örneğin, bazı hücreler diğerlerinden daha fazla DNA ve safsızlık içerir. DNA ekstraksiyon farkları hakkında daha fazla bilgi için okumaya devam edin.
Genel DNA Ekstraksiyonu
Bitki ve hayvan hücrelerine sabunlu bir madde uygularsanız, hücre ve nükleer zarlardaki lipitleri bozar. Ardından, DNA karışımı hücre zarlarından ve proteinlerden ayrılacaktır. Sonra, çözeltideki DNA'yı çökeltmek için alkol kullanabilirsiniz. Numunedeki miktara bağlı olarak, DNA çıplak gözle görülebilir. Bununla birlikte, bu basit prosedürün mutlaka yüksek saflıkta DNA üretmediğini unutmayın.
Bitki ve Hayvan Hücreleri
Bitki hücreleri, sert hücre çeperleri ve kloroplast gibi organeller nedeniyle hayvan hücrelerinden farklıdır. Ayrıca fotosentezde rol oynayan proteinler ve enzimler içerirler. Bazı bitki hücrelerinin poliploidi vardır, yani hücre başına her bir kromozomun birden fazla kopyası vardır. Ek olarak, fotosentez gibi bitkilerde meydana gelen hücresel işlemler bir dizi ikincil metabolit üretir. Hayvan hücrelerinin hücre duvarı yoktur, ancak genomik DNA'yı serbest bırakmak için hücre zarını bozmak için sodyum dodesil sülfat (SDS) gibi kimyasallara hala ihtiyaç duymaktadır.
Bitki DNA Ekstraksiyonu
Bitki genomik DNA'sının, bitkinin hücre duvarı nedeniyle elde edilmesi daha zordur. Homojenizasyon yoluyla veya hücre duvarını oluşturan selülozu parçalamak için selülaz ekleyerek çıkarabilirsiniz. Ek olarak, bitki hücresinde bulunan metabolitler, çökeltme işlemi sırasında DNA örneğini kirleterek genomik DNA ekstraksiyonuna müdahale edebilir.
Hayvan DNA Ekstraksiyonu
Periferik kan lökositleri, hayvan genomik DNA'sının ana kaynağıdır, ancak kanın doğrudan hayvandan gelmesi gerektiği için örnek toplama zordur. Kan, DNA örneğini kirletebilecek proteinler, lipitler, beyaz kan hücreleri, kırmızı kan hücreleri, trombositler ve plazma gibi çeşitli bileşikler içerir. Bununla birlikte, kan örneklerinden ekstrakte edilen hayvan DNA'sının birincil kirletici maddesi, hemoglobinin protein olmayan bileşeni olan heme'dir.
DNA Farklılıkları
Bitki ve hayvan DNA'sı arasındaki farklılıklar sarmaldaki bazların dizisinde yatmaktadır. Bitki hücrelerinde bulunan bileşikler, hayvan hücrelerinde yoktur ve DNA baz dizileri bunu yansıtır. Ayrıca, genomik bitki DNA'sı çoğunlukla hayvan DNA'sından daha büyüktür. Bu farklılıklar ayrıca ekstraksiyon yöntemlerini, verimi ve DNA'nın saflığını da etkiler.